Fullmetal Alchemist: The Conqueror of Shamballa

Munich, Jerman, 1923. Dua tahun telah berlalu sejak Edward Elric diseret dari dunianya sendiri meninggalkan negaranya, teman-temannya dan adiknya sendiri, Alphonse Elric. Stripped sebuah kekuatan alkimia yang selama ini telah ia teliti bersama dengan Alphonse Heiderich, seorang pemuda yang mirip saudaranya sendiri, Alphonse Elric. Ed berharap suatu hari dapat kembali bersama seperti dulu bersama Al.

Usahanya selama ini telah terbukti membuahkan hasil, tapi setelah ia meminjamkan tangan untuk seorang gadis gipsi yang bermasalah, Edward mendapati serangkaian peristiwa yang dapat mendatangkan malapetaka bagi kedua dunia. Sementara itu di dunianya sendiri, Alphonse Elric berusaha mencari misteri dari alkimia dan mencari cara untuk kembali bersama dengan kakaknya, Ed.